С целью недопущения войны на два фронта и военных провокаций со стороны Японии на Дальнем Востоке в сентябре 1941 года на базе Забайкальского военного округа был сформирован Забайкальский фронт. С этого момента его войсками командовал Михаил Прокофьевич Ковалёв, в июле 1945 года его сменил Родион Яковлевич Малиновский. Это были советские военачальники, имевшие за плечами немалый боевой опыт.
Байнов В.Г., граница с Маньчжурией. Фотография из фонда Забайкальского краевого краеведческого музея А. К. Кузнецова
15 сентября 1941 года в Чите начало действовать полевое управление фронтом. Ещё летом на территории округа проводились большие учебные сборы с массовой подготовкой автотранспорта и военнообязанных из гражданского населения. Автопарк комплектовался с большими трудностями из-за нехватки запчастей и плохого состояния техники. Напряжённость с техникой сохранялась и в начале 1942 года.
В Забайкалье в строгой тайне закладывались базы с оружием, продовольствием, подбирались бойцы и командиры партизанских отрядов, создавалась разведывательная сеть и партийное подполье.
В сентябре — октябре в Забайкальском округе проходили формирование 209-я, 210-я, в декабре — 97-я и 116-я стрелковые дивизии. В феврале, согласно приказу командования Забайкальским фронтом, создали 225, 226, 227, 229 и 232-ю отдельные стрелковые бригады, 321, 399 и 401-ю стрелковые дивизии. Часть из них были дивизиями и бригадами второго соединения.
Группа военных людей стрелкового батальона (среди них Л.И. Матвеев). Фотография из фонда Забайкальского краевого краеведческого музея А. К. Кузнецова
Всего за годы Великой Отечественной войны Забайкальский фронт направил на советско-германский фронт около 300 тысяч человек, более 2 тысяч орудий и миномётов, 1 400 танков.
В последующий период в состав фронта вошли 12-я воздушная и 6-я гвардейская танковая, 39-я и 53-я общевойсковые армии, участвовавшие в войне с Японией в августе 1945 года.
5 июля 1945 года в Читу прибыл маршал Александр Михайлович Василевский. Здесь находилась Ставка Главнокомандующего и штаб Забайкальского фронта во время военных действий на Дальнем Востоке. Василевский в ходе подготовки к предстоящим сражениям познакомился с войсками, осмотрел позиции, обсудил с командующими подразделений текущую обстановку. С переходом в наступление руководил действиями советских войск.
Члены фронтовых бригад, 1944-1945 гг. Фото из фондов Забайкальского краевого краеведческого музея им. А.К. Кузнецова
Маньчжурская стратегическая наступательная операция стала главным театром военных действий, где войска Забайкальского фронта сыграли решающее значение. В результате была разгромлена Квантунская армия, освобождены Сахалин и Курильские острова. После завершения военных действий войска Забайкальского фронта занимались разоружением японских войск.