В 1941 году фронт пролегал всего в нескольких десятках километров от Валдая. В сентябре Военный Совет Ленинградского фронта создал штаб руководства партизанским движением на оккупированных территориях Ленинградской области. В те годы город Валдай являлся её частью, было принято решение об организации здесь одной из оперативных групп штаба. На улице Народной до наших дней сохранился дом (№ 35), где с ноября 1941 года до 1944 года размещались оперативная штабная группа и Партизанский отдел Северо-Западного фронта, когда партизаны объединились с регулярными частями Красной Армии.
Домик на Валдае (штаб партизанского движения Ленинградской области). Н. М. Быльев-Протопопов. 1942 г.
Всё это время здесь находился кабинет А. А. Тужикова (1909–1993) — старшего батальонного комиссара, заместителя начальника Партизанского отдела. Отсюда контролировалось 25 районов страны, выпускался целый ряд партизанских газет и листовой. В Валдае партизаны отдыхали и лечились. В деревне Едрово Валдайского района находилась партизанская авиационная база.
Заместитель начальника оперативной группы Ленинградского штаба партизанского движения на Северо-Западном фронте А. А. Тужиков
Командование концентрировало силы, объединяя разрозненные отряды в партизанские бригады, которые могли навязать противнику свою тактику. Было необходимо обеспечить огневую силу и организовать систему обучения. В бригадах и отрядах создали сеть партийных и комсомольских организаций. Главную роль в партизанском движении по всей линии Северо-Западного фронта сыграла 2-я Ленинградская партизанская бригада, которая стала настоящей угрозой для немцев. Поэт-партизан И. В. Виноградов (1918–1995) посвятил ей песню: «Дрожи, зверьё германское, когда с тобой / Вторая Партизанская вступает в бой!»
Редактор партизанской газеты И. В. Виноградов
Её командиром был Н. Г. Васильев (1908–1943). Ещё в конце лета 1941 года отряды бригады перешли линию фронта и обосновались в псковских лесах, где больше года удерживали от натиска врага целый партизанский край с 200 сёлами и деревнями. В переходах по сырым лесам комбриг сильно простудился. На самолёте его доставили в тыл, но в марте 1943 года он скончался от туберкулеза лёгких. В честь героя в Валдае назван проспект.
В сентябре 1941 года была образована 4-я бригада Валдайского направления (с января 1942 г. — 5-я бригада) численностью 236 человек. Это резервное подразделение служило для пополнения бригад, действовавших непосредственно против немецких войск.
Герой Советского Союза, подполковник второй Ленинградской партизанской бригады Н. Г Васильев
Люди, которые находились по ту линию фронта, вместе со всей страной поддерживали Красную Армию, передавали через партизан средства в Фонд обороны. Поразительная страница народной поддержки блокадного Ленинграда — сбор продуктов, осуществлявшийся в феврале — марте 1942 года в партизанском крае. Ночами через болота и леса шли две сотни замаскированных санных подвод с зерном, мясом, маслом и мёдом (всего 3,5 тысячи пудов). Партизаны обеспечивали вооружённый коридор. Ленинградский поэт Виссарион Саянов писал:
«Мы идем бездорожьем, где пламя,
Где пожарища грозная тень.
Братья кровные! Слышите? С вами
Партизаны родных деревень».
В. М. Саянов
Небывалый обоз преодолел 120 км пути, обойдя укрепления врага. В тылу продовольствие перегрузили на машины и отправили в Ленинград, где делегацию встретили руководители города. Секретарю ЦК ВКП(б) А. А. Жданову вручили чек на 127 тысяч рублей, собранных населением партизанского края и сданных в Валдайское отделение Госбанка.
Секретарь ЦК ВКП(б) А. А. Жданов
В мае 2022 года Валдаю было присвоено звание Города партизанской славы. В 2023 году на площади Свободы был установлен соответствующий памятный знак.