Александр Николаевич Балакшин родился 26 октября 1844 года в семье ялуторовского купца Николая Яковлевича Балакшина. Отец Александра был человеком с широким кругозором и прогрессивными взглядами, он поддерживал дружеские отношения с декабристами. Неслучайно Александр окончил всесословную школу для мальчиков, открытую в Ялуторовске по инициативе декабриста Ивана Дмитриевича Якушкина.
В 1860 году он окончил Тобольскую гимназию и поступил в Казанский университет. В связи с активным участием в общественной жизни и революционно-демократических кружках был исключён из университета в октябре 1861 года.
В качестве наказания его выслали на родину под надзор полиции. В Ялуторовске он поступил в Военно-медицинскую академию, но, осознав, что это не его призвание, не окончил обучение.
После отбытия наказания сын купца Александр Николаевич Балакшин кардинально изменил свою жизнь. Он обосновался в селе Логовушка Курганского уезда Тобольской губернии и открыл крахмало-паточный завод. При заводе он основал метеорологическую станцию, опытное поле для акклиматизации различных сортов картофеля, ввёл шести- и семипольные севообороты и собрал коллекцию местных почв.
Александр Николаевич стал одним из организаторов сибирского артельного маслоделия. В 1897 году он содействовал открытию двух маслодельных заводов. В это же время его назначили руководителем Курганского отдела Императорского Московского общества сельского хозяйства. В 1902 году по его инициативе была основана «Правительственная организация по устройству кооперативных маслодельных товариществ в Западной Сибири».
7 сентября 1902 года на открытии первой выставки продуктов маслоделия и съезда маслоделов в Кургане А. Н. Балакшин выступил с программной речью о кооперировании. По его инициативе съезд принял решение ходатайствовать перед правительством о предоставлении льготного кредита маслодельным артелям, о получении ссуд из Государственного банка на покупку машин, об учреждении в Сибири опытных молочно-хозяйственных станций с лабораториями.
Вскоре такие станции были открыты, что стало мощным стимулом для развития маслодельной промышленности. В том же 1902 году департамент земледелия выделил 100 тысяч рублей на строительство школы молочного хозяйства и установил ежегодную субсидию в размере 10 тысяч рублей на её содержание.
В 1907 году Александр Николаевич Балакшин вместе с партнёрами организовал «Союз сибирских маслодельных артелей». Основной задачей организации было устранение посредников в торговле сибирским маслом и выход на зарубежные рынки. До этого масло продавалось через экспортные конторы, которые устанавливали произвольные закупочные цены.
В 1912 году сибирские маслоделы объединились с английской фирмой «Лонсдейль» для создания «Союза сибирских кооперативных ассоциаций “Юнион”». Александр Николаевич переехал в Лондон для управления делами компании. Так на мировом рынке появился продукт под маркой «Белый лебедь». Конторы «Юниона» открылись также в Берлине и прибалтийских портах. В итоге иностранные компании-конкуренты были вынуждены повысить закупочные цены на сибирское масло.
В 1916 году, в возрасте 71 года, Александр Николаевич отошёл от дел. В одном из писем он подвёл итог своей деятельности:
«Я был скромным сеятелем, и мне уже не дожить до того светлого дня, когда могучее кооперативное движение объединит всё сельское население Сибири и перестроит всю деревенскую жизнь на новых началах. Я твёрдо верю в скорое наступление этого дня и вперёд благословляю».